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图机器学习导论
学习路径与必读论文清单
- 斯坦福CS224W(子豪兄中文精讲)
 - 知识图谱实战
 - Deepwalk
 - Node2vec
 - PageRank
 - GNN
 - GCN
 - Gragh-SAGE
 - GIN
 - GAT
 - Trans-E
 - Trans-R
 
图无处不在
图是描述关联数据的通用语言
 举例
- 计算机网络
 - 新冠肺炎流行病学调查传播链
 - 食物链
 - 地铁图
 - 社交网络
 - 经济网络
 - 通信网络
 - 互联网
 - 论文引用网络
 - 人神经元神经网络
 - 医疗图谱
 - 基因和蛋白质的调控网络
 - 场景网络
 - 代码也可以抽象为图
 - 分子图
 - 三维建模模型图
 - 人体关键点检测
 - 张量图
 
数学上图论起源于哥尼斯堡七桥问题
如何对图数据进行数据挖掘
节点和连接组成的图
 传统机器学习数据样本之间独立同分布
 现代深度学习方法用来解决表格矩阵序列数据,还没有专门处理关联数据的神经网络
 图机器学习是人工智能和深度学习的新蓝海
##* 机器学习的热点
- 图神经网络
 - 对抗学习
 - 元学习
 - NAS
 - 自监督学习
 - bert
 - nlp
 - 连续学习
 
图深度学习的难点
任意尺寸输入
 没有固定的节点顺序和参考锚点
 动态变化
 多模态特征
图神经网络

 ##图神经网络
课程概述
传统机器学习方法:Graphlets,Graph Kernels
 node embedding:DeepWalk,Node2Vec
 图神经网络:GCN,GraphSAGE,GAT,Theory of GNNS
 知识图谱和推理:
 生成新的图:GraphRNN
 图数据挖掘
课程目录

 课程主页:http://cs224w.stanford.edu
 参考书籍:Graph Representation Learning Book
 课程每一章都是独立的
图机器学习、图神经网络编程工具
PyG:www.pyg.org
 NetworkX:networkx.org
 DGL:www.dgl.ai
 AntV图可视化工具Graphin:graphin.antv.vision
 AntV图可视化工具G6:g6.antv.antgroup.com
 Echarts可视化:echarts.apache.org/examples/zh/index.html#chart-type-graphGL
图数据库库排名

图机器学习应用

任务层次
节点层面
 信用卡欺诈
连接层面
 推荐可能认识的人
子图层面、社群层面
 用户聚类
图层面
 分子是否有毒
 生成新的分子结构
图机器学习任务
- 节点分类
 - 连接预测
 - 图分类
 - 聚类
 - 其他任务
图生成
图演化 
Example

 
 
 
 

AlphaFold
AlphaFold官网:https://www.deepmind.com/research/highlighted-research/alphafold
AlphaFold蛋白质数据库:https://alphafold.ebi.ac.uk
AlphaFold博客1:https://www.deepmind.com/blog/alphafold-using-ai-for-scientific-discovery-2020
AlphaFold博客2:https://www.deepmind.com/blog/alphafold-reveals-the-structure-of-the-protein-universe
AlphaFold自然杂志论文:https://www.nature.com/articles/s41586-019-1923-7.epdf?author_access_token=Z_KaZKDqtKzbE7Wd5HtwI9RgN0jAjWel9jnR3ZoTv0MCcgAwHMgRx9mvLjNQdB2TlQQaa7l420UCtGo8vYQ39gg8lFWR9mAZtvsN_1PrccXfIbc6e-tGSgazNL_XdtQzn1PHfy21qdcxV7Pw-k3htw%3D%3D
AlphaFold代码:https://github.com/deepmind/deepmind-research/tree/master/alphafold_casp13
百度文心·生物计算大模型:https://wenxin.baidu.com/wenxin/paddlehelix
人工智能在药物发现和生物技术中的应用:2022年回顾与关键趋势:https://mp.weixin.qq.com/s/ZuDpd2YqHpDiRqw9GIXolw
图背后的商业价值
人的本质就是社会关系的总和
 江湖不是打打杀杀江湖就是人情世故,江湖就是图
 举例
- Google的搜索引擎
 - 抖音、微博、B站的内容推荐
 - 银行的风控信用卡欺诈
 
图是最优质的长期资产
 网络效应是一个企业最深的护城河
几个图数据挖掘项目
- ReadPaper(ReadPaper.com)
 - Connected papers(connectedpapers.com)
 - BIOS(bios.idea.edu.cn)
 - 刘焕勇主页:https://liuhuanyong.github.io
 
总结
图是描述大自然的通用语言
 图蕴含了巨大的商业价值和科研价值
 图在过去现在未来都在改变各行各业
 图机器学习是长期通用技能
 图机器学习可以和人工智能方向结合(大模型、多模态、可信计算、NLP)
