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物理存储方式不同：

 1. InnoDb默认数据结构是聚簇索引；MyISAM 是非聚簇索引

 2. 聚簇索引 中表索引与数据是在一个文件中 .ibd；非聚簇索引中表索引（.MYI）与数据(.MYD)是在两个文件中

 3. 聚簇索引中表数据行都存放在索引树的叶子节点中；非聚簇索引中表数据行则存放在数据块中，叶子节点存储的是数据块的指针

 4.  聚簇索引中索引和数据存在同一个B-Tree中，非聚簇索引需要先查询索引文件，得到索引，然后根据索引获取数据；所以从聚簇索引中获取数据通常比在非聚簇索引中查找要快